真菌存活时间受环境、种类等多种因素影响，没有固定时长。在适宜条件下，部分真菌孢子可存活数年甚至更久，而在不适宜的环境中，其存活时间会显著缩短。了解真菌存活的影响因素，对预防和控制真菌感染有重要意义。
从环境温度来看，多数真菌适宜在22-36℃的环境中生长繁殖，此温度区间内，真菌代谢活跃，能长时间保持活性。当环境温度超过60℃，真菌细胞内的蛋白质、酶等物质会变性，导致其死亡，高温灭菌就是利用这一原理。低温环境下，真菌生长会受到抑制，但部分真菌孢子在零下数十度的环境中仍可存活数年，等待合适条件复苏。
湿度也是影响真菌存活的关键因素。真菌喜潮湿环境，在相对湿度80%以上的环境中，它们能获取足够水分维持生命活动，存活时间长。在干燥环境中，真菌细胞会因水分流失，代谢活动减弱甚至停止，无法长时间存活。例如在沙漠等极端干燥地区，真菌数量和存活时间明显低于湿润地区。
不同种类的真菌存活能力存在差异。常见的皮肤癣菌，如引起足癣、手癣的真菌，在适宜环境中，菌丝体可存活数周，孢子存活时间更久，可达数月至数年。一些致病力强的深部真菌，像新型隐球菌，其孢子在土壤中能存活数年，增加了传播和感染的风险。而部分腐生真菌，离开适宜的腐殖质环境后，存活时间会大幅缩短。
真菌在不同物体表面的存活时间不同。在光滑的塑料、玻璃等表面，真菌因缺乏营养物质，存活时间较短，通常只有数天。而在织物、木质等多孔材料表面，真菌不仅能附着，还可利用材料中的有机成分作为营养源，存活时间可达数周甚至数月，这也是衣物、家具等容易滋生真菌的原因。
光照和空气流通情况同样影响真菌存活。紫外线具有杀菌作用，长时间暴露在阳光下，真菌细胞的DNA会受到损伤，存活时间缩短。良好的空气流通能降低环境湿度，减少真菌所需的水分，抑制其生长，使其存活时间变短。相反，通风不良、阴暗的环境则有利于真菌长时间存活。
在人体内部，真菌存活与机体免疫力密切相关。健康人体的免疫系统可识别并清除入侵真菌，限制其存活和繁殖。但当人体免疫力下降时，原本处于抑制状态的真菌会大量繁殖，存活时间延长，引发真菌感染。如艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂者，更容易发生真菌感染且持续时间长。