结核杆菌阴性一般指结核分枝杆菌阴性，主要是通过镜下痰液发现结核分枝杆菌，或通过结核菌培养检测等明确检查结果。通常代表受检者体内没有结核分枝杆菌感染，但也要注意警惕假阴性的情况。
1、没有结核分枝杆菌感染：如果受检者体内没有结核分枝杆菌感染，检测后就会出现结核分枝杆菌阴性的结果，常见于健康人群，或既往有结核分枝杆菌感染，但经过规范足量的抗结核治疗后，体内结核分枝杆菌已被完全清除的人群，一般无需特殊治疗；
2、假阴性：由于痰培养、结核菌培养等检查都有一定的漏检情况，常见于患者免疫功能异常、检测试剂盒出错、检验方法不当等，所以可能出现假阴性结果。尽管结核分枝杆菌为阴性，但部分患者仍明显的结核分枝杆菌感染症状、体征以及影像学表现，所以要考虑是否存在结核分枝杆菌感染。建议隔一段时间后进行复检，确诊后可积极进行抗结核治疗。