娃娃反复发烧两三天，主要考虑与病毒感染、细菌感染、支原体感染、寄生虫感染有关，但也可见于幼儿急疹等。出现此情况时，应及时到医院化验血常规，积极寻找原因。
1、病毒感染：如果血常规结果显示白细胞总数正常或降低，淋巴细胞或单核细胞增高，一般提示反复发烧两三天是由于病毒感染所引起，通常还可伴随头痛、咳嗽、疲劳、乏力等症状。除血常规检查外，也可通过流感病毒的核酸检测明确诊断，确诊后建议遵医嘱使用磷酸奥司他韦、利巴韦林等抗病毒药物进行治疗。
2、细菌感染：如果血常规结果显示白细胞总数增高，尤其中性粒细胞增高明显，通常是由于细菌感染引起。一般发烧时，还会伴有寒战、四肢末梢凉、流黄涕等症状，可遵医嘱给予抗生素进行治疗，比如青霉素、头孢菌素等。
3、支原体感染：如果外周血化验提示支原体呈阳性，表示反复发烧是由于支原体感染引起，常伴咽喉干痒、咳嗽等症状。此时可遵医嘱使用大环内酯类药物，六个月以上患儿可使用阿奇霉素或罗红霉素进行治疗，六个月以下患儿可使用依托红霉素颗粒进行治疗。
4、寄生虫感染：寄生虫通过血液、消化道进入人体，可导致反复发烧，可遵医嘱使用吡喹酮片等药物治疗。
5、幼儿急疹：部分娃娃反复发烧，且无其他明显感染症状，应考虑是由于幼儿急疹导致的反复发热，一般在热退后，小孩身上会开始出现皮疹等皮肤改变。可以配合医生使用对乙酰氨基酚或布洛芬等治疗。
除以上因素外，若娃娃反复发烧，两三天也不好，也可能是血液性疾病，如白血病等导致，可在医生的指导下使用注射用硫酸长春新碱、注射用阿糖胞苷等。