在临床上左输尿管上段结石指位于肾盂输尿管连接部到骶髂关节上缘输尿管结石，应及时治疗，由医生结合患者临床症状、结石大小、硬度、是否有感染及肾功能等情况采取相应治疗方法，一般包括对症治疗、保守药物治疗、体外冲击波碎石治疗、输尿管镜碎石及经皮肾镜超声碎石取石治疗等。
1、对症治疗：主要为解痉止痛治疗，左输尿管上段结石患者常常出现阵发性肾绞痛，疼痛发作时坐卧不安，大汗淋漓，往往伴有恶心、呕吐等，此时需要予以解痉止痛对症治疗，缓解症状减轻痛苦，常用药物为阿托品，消旋山莨菪碱片，酮咯酸氨丁三醇片等；
2、保守治疗：适用于左输尿管上段结石直径小于5mm，表面光滑为椭圆或圆形，结石远端尿路没有狭窄，且肾功能良好的患者，可通过多喝水，使每天产生尿液2000毫升左右，多运动，或辅助一些排石颗粒等药物治疗；
3、体外冲击波碎石：适用于左输尿管上段结石直径在5-10mm，结石质地不是很硬，没有明显尿路感染，且肾功能良好，结石以下尿路没有梗阻的患者，可遵医嘱采用体外冲击波碎石。但可能需要多次碎石，若超过3次没有明显效果，则建议改用手术取石治疗；
4、输尿管镜碎石：左输尿管上段结石外科治疗几乎都是微创腔镜治疗，大大提高了输尿管上段结石的治疗成功率。主要用于保守治疗和体外冲击波碎石治疗无效的患者，或结石直径大于10mm，结石CT值大于1000HU。具有手术创伤小、碎石效果好的优点，但需要住院花费较高；
5、经皮肾镜超声碎石取石：特别适用于左输尿管上段结石直径比较大、位置比较高，且距离肾盂较近，肾积水比较明显或还伴有肾结石的患者。具有碎石好，结石清除率比较高的优点。