龋齿里面的脏东西，可通过冲洗、清洁或由专业医生操作挖出来。龋齿里面的脏东西，应是腐败坏死组织，是由食物残渣嵌塞、细菌滋生、有机质混合而形成。
若患者龋齿里面的脏东西较少，附着不深，一般可自行在家通过冲牙器、牙签、牙线进行清除，将脏东西挖出来。但使用牙线、牙签时由于视角问题，可能清理龋齿内脏东西较困难，而且容易造成周围牙龈、牙体损伤。此时可以借助冲牙器，利用水流冲击压力，将龋齿里面的脏东西冲洗出来，冲牙器操作较灵活，而且对牙齿及周围组织损伤较小。
对于龋齿里面较顽固、不好清除的脏东西，可在专业医生操作下，通过三用枪、口镜、探针和镊子等口腔科器械，将龋齿里面的脏东西挖出来，再使用过氧化氢溶液冲洗龋洞，分解坏死物质。而龋齿附近邻牙上的脏东西可通过车针、纱条摩擦去除。龋齿内脏东西被挖出清理后，需及时对龋齿窝洞进行填充、修复，防止再次出现食物嵌塞，造成细菌滋生，以免继发感染的发生。在日常生活中，需要保持口腔清洁，养成饭后漱口、睡前刷牙的习惯，可有效避免龋齿的发生。