比阿培南和美罗培南的区别，主要在于抗菌活性、安全性、起效速度、耐药性等方面。比阿培南和美罗培南都是临床上常用的碳青霉烯类抗生素，抗菌谱广、抗菌活性强、副作用小，适合治疗革兰氏阳性球菌和革兰氏阴性杆菌所引起的严重感染。
1、抗菌活性：对葡萄球菌、肠球菌等革兰氏阳性菌引起的感染，比阿培南的疗效明显优于美罗培南。但对大肠杆菌、肺炎克雷白杆菌等肠杆菌属感染，美罗培南比比阿培南有更强的活性；
2、安全性：比阿培南的副作用比美罗培南要小，尤其是对中枢神经系统的损害更轻，肾损害也比较轻，很少引起尿素氮、肌酐升高；
3、起效速度：比阿培南比美罗培南起效更快，杀菌作用更强，通常使用后可以迅速杀死细菌，从而起到迅速退热的作用；
4、耐药性：美罗培南在临床的使用时间比较长，因此，细菌耐药性比较高，而比阿培南的临床使用时间短，细菌耐药率相对比较低。
因此，建议患者根据自身的具体情况，在医生的指导下，选择更适合自己的抗生素进行治疗。