根尖孔最常见的位置就是根尖顶端，也可能会根据牙位不同有所变化，建议患者到正规医院就诊，在专业医生指导下给予治疗。
根尖孔主要分为解剖性根尖孔、生理性根尖孔，解剖性根尖孔指根管在牙根表面开口，有时位于根尖，有时位于牙根侧方。生理性根尖孔指根管在接近根尖时的一个狭窄部位，一般被认为是牙本质牙骨质界。
解剖性根尖孔和生理性根尖孔可能在不同的部位，也有可能会重叠在一起，大部分情况下，两者距离在0.5-1mm范围内，是髓腔预备和充填终止点。根尖孔最常见的位置是根尖顶端，也可以偏向根尖端的任意一侧，即唇侧、舌侧、近中或远中，不同牙位的偏向差异很大。
此外，随着年龄的增大，根尖不断有牙骨质的沉积，也会造成生理性根尖孔远离根尖顶。因此掌握根尖孔的位置、形态，为确定根管工作长度、提高根管治疗质量的基础。
但实际为患者进行根管治疗的过程中，由X线检查观察根管预备和充填情况时，不能只以根尖为标准，应用电测仪器、结合X线片以及患者的主观感觉判断较为合适，以达到预期的治疗效果。