抗病毒口服液和蓝芩口服液的区别主要是药物成分、药物功效等方面，另外二者的临床用途也不一样，患者应合理用药，在医生指导下服用。
1、药物成分：抗病毒口服液主要由连翘、广藿香、板蓝根、知母、石膏、芦根、地黄、郁金、石菖蒲组成，而蓝芩口服液由板蓝根、黄芩、栀子、黄柏、胖大海组成；
2、药物功效：抗病毒口服液能够起到凉血解毒、祛湿清热的功效，蓝芩口服液具有清热解毒、利咽消肿的功效；
3、临床用途：抗病毒口服液适用于病毒性感冒，特别是流感，可用于治疗风热感冒，患者多表现为发热、怕风等，而蓝芩口服液主要适用于急性咽炎，可治疗肺胃实热证所导致的咽痛、咽干、咽部灼热等。
患者在服用上述两种药物时，需要多喝水，以促进新陈代谢，可以适当进行体育运动，平时注意饮食清淡。在服药期间不要进食辛辣、刺激性的食物，以免影响药物的治疗效果。