乙肝E抗原阴性(-)一般指的是乙肝病毒e抗原阴性，见于患者没有被乙型肝炎病毒感染、乙型肝炎病毒复制能力较弱、前C区基因突变而不产生乙肝病毒e抗原。建议患者前往感染科、肝病科等科室就诊。
乙肝病毒e抗原检查结果是阴性，同时患者乙肝表面抗原也是阴性，往往提示机体没有被乙型肝炎病毒感染，见于正常人群。乙肝病毒e抗原阴性且乙肝表面抗原阳性，见于乙肝病毒e抗原阴性的慢性乙型肝炎，这种情况下，乙肝病毒e抗原为阴性，可提示体内乙型肝炎病毒复制不活跃，血液中病毒含量少，传染性弱，主要见于慢性乙型肝炎患者发生自发乙肝病毒e抗原血清学转换，也见于经过治疗后，发生乙肝病毒e抗原血清学转换的患者。
乙肝乙肝病毒e抗原阴性且乙肝表面抗原阳性，还见于乙肝病毒发生了前C区基因突变，而前C区突变后，乙型肝炎病毒往往不表达乙肝病毒e抗原，因此可出现乙肝病毒e抗原阴性。此时患者体内有大量的乙型肝炎病毒复制，这种变异乙型肝炎病毒往往会引起转氨酶升高，而且病情比较严重。