染色体缺失导致无精症能否治疗，与染色体缺失的具体片段有关。如果是a区、b区缺失的无精症，一般无法治疗。对于c区、d区缺失的无精症，可以做手术取精进行治疗。
Y染色体的长臂末端有一段控制精子生成的区域，称之为AZF。如果染色体缺失导致无精症的患者，是AZF的a区、b区缺失，产生精子的可能性较小。通过各种取精的方法，找到精子的可能性也较小，无法通过辅助生育技术成功受孕，不能治疗。对于c区、d区缺失合并的无精症的患者，大约50%的患者可以通过手术取精找到精子，再做辅助生殖技术，成功受孕。部分c区、d区缺失导致无精症的患者找不到精子，可以通过显微镜取精的方法，判断是否有残存的生精功能。
染色体缺失导致的无精症，在临床上是较常见，需要在医生的指导下，进行个体化的分析，并采取个体化的治疗方法。