发霉的南瓜切掉了好的部分是否还能吃，要视具体情况具体分析。如果南瓜只是刚发霉，将发霉的地方切掉后，还可以吃，此时南瓜发霉的时间短，如在一天内，细菌尚未侵袭到南瓜果肉，切掉发霉部分后，剩余的南瓜是可以食用的，但也不建议食用，以免导致身体出现不适症状。
但是如果南瓜发霉时间较长，并且带有微微的酸味，说明南瓜已经腐败较严重。这种发霉腐败的南瓜中所含有的氨基酸、蛋白质、淀粉、维生素C等营养成分已经流失，并且会产生大量黄曲霉素等有毒物质，黄曲霉素耐高温，经过加热烹饪后也很难去除。如果此时吃了变质的南瓜，轻则发生腹泻、呕吐等症状，大量摄入可能会导致黄曲霉素中毒，表现出腹痛、反酸、烧心等症状。
应避免食用霉变的食物，如一次吃不完，可以将蔬菜水果放入冰箱冷藏，保持新鲜程度。建议多食用新鲜的食品，提倡营养均衡、荤素搭配，饮食上还应该多吃蔬菜、水果、鸡蛋、牛奶、瘦肉等，少吃刺激辛辣的食物，更有利于身体健康。