生殖器有黑色斑点，一般指男性患者阴茎处以及女性患者外生殖器有黑色斑点，可能与色素沉着相关，多由于个人卫生习惯、饮食习惯等因素导致，如果未出现明显的斑点增长表现，则无需过度担心，也无需特殊处理。但色素沉着还可能由于其它因素导致，如色素痣、尖锐湿疣、龟头炎等。
1、色素痣：又称为痣细胞痣，属于黑色素细胞起源的良性皮肤肿瘤，可呈棕色、褐色、蓝黑色或黑色，多无自觉症状。常见于易摩擦部位如生殖器、腋窝、腹股沟、肩部等，出现于男性患者阴茎以及女性患者外生殖器处，通常无需特殊治疗；
2、尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒所致，常发生在外生殖器及肛门等部位，好发生于性活跃的青中年患者，主要通过性行为传染。男性多见于龟头、冠状沟、尿道口、阴茎部等部位，女性多见于外生殖器部位，比如会阴。部分患者的尖锐湿疣除黑色斑点外，还可呈现淡红色小丘疹，还有部分患者呈白色、粉红色或污灰色，且表面易发生糜烂，有渗液、浸渍及破溃等表现，可通过激光、冷冻等物理方法进行治疗，也可外用咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶乳膏等进行治疗；
3、龟头炎：主要与创伤、感染等有关，男性患 者在出现龟头炎时，炎症刺激下，可能导致龟头部位发紫、发黑，此时可能还会伴有疼痛、瘙痒等症状，可使用甲硝唑、氟康唑等药物进行治疗。
此外，如果生殖器部位受到严重外伤等，也会引起这种情况，如果伴有明显疼痛症状，可以及时到医院就诊并明确诊断。平时要注意勤用温水清洗外生殖器，并勤更换内裤。