盐酸多西环素肠溶胶囊属于四环素类消炎药，可用于治疗立克次体病(如流行性斑疹伤寒、地方性斑疹伤寒、羌虫病)、支原体属感染、衣原体属感染(如鹦鹉热、淋巴肉芽肿、非特异性尿道炎、输卵管炎、宫颈炎及沙眼等)。由于目前常见致病菌对四环素类耐药现象严重，仅在病原菌对本品敏感时，方有应用指征，葡萄球菌属大多对本药品耐药。
应用本品时，因该药品在动物实验中有致畸胎作用，因此孕妇及哺乳期妇女禁止服用。此外，还可能发生耐药菌过度繁殖的现象，一旦发生二重感染，应立即停用本药，并予以相应治疗。治疗性病时，如果怀疑同时合并梅毒螺旋体感染，用药前需完善暗视野显微镜检查及血清学检查，长期用药的人群应定期回医院随访，并检查血常规及肝功能。