冠状动脉瘘介入手术属于根治性手术，一般术后恢复良好，手术后复查心脏结构可与正常人一样，病人的活动能力、劳动能力，以及寿命和正常人一样。
如果冠状动脉瘘小于1-2mm，没有造成太大影响，不一定需要立即治疗，可以每半年复查一次心脏超声。因为部分病人能够自然愈合，并不需要特殊处理。如果冠状动脉瘘的瘘口超过3mm，会形成大量的左向右分流，对心功能造成一定影响，可能会出现反复肺部感染，以及心脏杂音等，甚至会引起心肌缺血、心绞痛等情况。冠状动脉瘘瘘口较大的病人，应尽早进行手术治疗，手术可以通过微创介入封堵冠状动脉瘘。但如果瘘口较大，无法进行介入封堵，需要常规开胸手术修补冠状动脉瘘。术后寿命与常人基本相同，不会影响生命。手术后应在医生指导下，使用阿司匹林等抗血小板药物，并定期复查心脏超声、心电图，明确是否恢复良好。
冠状动脉瘘介入有一些禁忌证，包括多发性冠状动脉瘘口、受累冠状动脉极度偏曲、冠状动脉瘘口过粗难以封堵，以及栓塞后有可能影响远端冠状动脉供血，或产生新的、更明显心肌缺血改变者。