生物碱是天然一种含氮的有机化合物，应用于临床的生物碱有100种以上，其中一部分生物碱可作为治疗使用，有一些生物碱具有很强的毒性，即使作为药物使用，用量不当也可能致人死亡。
1、毒性作用：如乌头碱，乌头碱具有局部麻醉、镇痛活性，广泛应用于治疗类风湿关节炎，但是乌头碱可以对人的心脏传导系统、神经系统，以及消化系统产生毒副作用，可以引起患者出现心律失常、血压下降、头晕、腹痛、恶心等症状，严重者会出现心室颤动，用量过多可导致心肌麻痹而死亡。另外一些千里光属和野百合属植物中的生物碱惰性较大，能够导致肝中毒，患者可以有恶心、腹胀、黄疸、昏迷等症状；
2、依赖性：长期使用某些生物碱容易使人产生依赖性，甚至严重危害人群健康，如吗啡、可待因等，这些生物碱主要作为强烈的镇痛药物使用，镇痛作用能够持续6个小时，同时还具有镇咳作用，一般用于晚期癌痛的患者，但容易成瘾，成瘾后患者常有食欲不佳、精神萎靡，甚至会出现抑郁、伤人行为等。