磷酸肌酸激酶同工酶主要存在于骨骼肌和心肌中，磷酸肌酸激酶同工酶偏高，通常提示可能存在心肌损伤，也可能存在骨骼肌的损伤，具体还需在医生的建议下完善相关检查进行鉴别诊断。
1、心肌损伤：若就诊者的磷酸肌酸激酶同工酶偏高，还需要关注磷酸肌酸激酶总水平，根据这两项指标的比值进行判断。如果磷酸肌酸激酶总水平与磷酸肌酸激酶同工酶的比值小于10：1，通常说明就诊者存在心肌的损伤，具体原因可能为冠心病、心肌梗死、心肌炎、心衰等，其中心衰可包括心肌病的心衰，心动过速的心衰及心梗后的心衰等；
2、骨骼肌的损伤：如果磷酸肌酸激酶总水平与磷酸肌酸激酶同工酶的比值大于10：1，可提示磷酸肌酸激酶同工酶的偏高是源于骨骼肌的损伤，如过度的锻炼、游泳、跑步后，就可导致数值偏高。此外，也可见于骨骼肌疾病、肌萎缩、重症肌无力等情况。
另外需要注意，磷酸肌酸激酶同工酶数值偏高，也可能是由于服用他汀类降脂药引起，因此需积极排查原因，根据诱因进行针对性的治疗。