生化妊娠是指血中或尿中一过性检测到人绒毛膜促性腺激素升高，但随后自然下降且超声检查未能探及孕囊的现象，属于自然流产中的早期流产，通常是精神因素、环境因素、胚胎因素、免疫因素、母体疾病等导致，一般不会造成不孕。
1、精神因素：如果孕妇心情不稳定，长时间情绪紧张、心情焦躁有可能导致体内激素水平变化，引起生化妊娠。
2、环境因素：过多接触放射线和砷、铅、甲醛苯氯丁二烯、氧化乙烯等化学物质，均可能引起生化妊娠。
3、胚胎因素：胚胎或胎儿染色体异常是早期流产最常见的原因，占50%-60%，染色体异常包括数目异常和结构异常，前者以三体最多见，后者引起流产并不常见，主要有平衡易位、倒置、缺失和重叠及嵌合体等。
4、免疫因素：其包括同种免疫因素，即精子、精浆或受精卵是抗原物质，被阴道及子宫上皮吸收后通过免疫反应产生抗体物质，使精子与卵子不能结合或受精卵不能着床，以及自身免疫因素，即孕妇血清中存在抗透明抗体，与透明带反应后可防止精子穿透卵子，阻止受精而造成不孕。
5、母体疾病：如孕妇存在严重感染、严重贫血或心力衰竭、血栓性疾病、慢性消耗性疾病、慢性肝肾疾病或高血压等。存在生殖器异常，如子宫畸形、子宫肌瘤、子宫腺肌病、子宫腔粘连等，均可影响胚胎着床发育而导致生化妊娠。另外，内分泌异常、强烈应激与不良习惯、免疫功能异常等均可能引起。
在早期流产中约2/3为隐性流产，即发生在月经期前的流产，也称生化妊娠，部分人群可能误以为月经，胚胎多在排出之前已死亡，妊娠物通常能完全排出，通常不会影响身体健康，也对后续妊娠产生不利。
除上述常见因素外，精子质量较差或精子畸形等因素也可导致生化妊娠，当出现生化妊娠后可以及时到医院妇产科就诊，进行腹部B超等检查，明确诊断后在医生指导下进行针对性治疗和调理。