甲肝、乙肝、丙肝三种肝炎的区别主要在于病原体不同、传播途径不同、治疗不同等方面。三种疾病都属于病毒性、传染性疾病，一年四季均可发病，除了这三种以外还有丁肝、戊肝，都是肝功能减弱的相关疾病。
1、病原体不同：甲肝是由甲型肝炎病毒引起，属于RNA病毒；乙肝的病原体为乙型肝炎病毒，属于DNA病毒；丙肝病原体为丙型肝炎病毒，属于RNA病毒；
2、传播途径不同：甲肝主要的传播途径为粪-口途径；乙肝主要的传播途径为血液、体液传播，也可通过母婴传播，感染乙型肝炎病毒后可以不断地进展，出现慢性肝炎、肝硬化，甚至发生肝癌；丙肝主要通过输血及血制品，注射、针刺、器官移植、骨髓移植、血液透析，以及性接触进行传播，随着疾病的不断发展可以引起肝硬化和肝癌；
3、治疗不同：甲肝治疗主要以休息、对症治疗为主，没有特效的抗病毒药物；乙肝以抗病毒治疗为主，可以选择干扰素进行治疗，也可以选择核苷类药物，如拉米夫定、阿德福韦酯、恩替卡韦、富马酸丙酚替诺福韦片等进行治疗；丙肝治疗方案为干扰素治疗，目前常选择索磷布韦维帕他韦片抗病毒治疗。
除了以上区别以外，甲肝的潜伏期为2-6周，平均为4周；乙肝潜伏期为1-6个月；丙肝潜伏期2周到6个月。另外，甲肝可以用甲肝减毒活疫苗进行预防，乙肝可以接种乙型肝炎疫苗预防，丙肝没有疫苗进行预防。
当出现甲肝、乙肝、丙肝这三种疾病时应及时进行隔离，做好个人卫生，保护水源，患者所使用过的食品、物品都要进行消毒，切断传播途径，必要时还要避免同房，防止感染。在治疗期间，患者应定期进行相关的检查，定期复查，防止疾病的复发。