胎儿的肾囊肿是否能够自己吸收，主要取决于肾囊肿的大小、是否有其他异常、是否为单侧肾囊肿等因素。如果胎儿是较小的单侧肾囊肿，则可能属于胎儿肾脏发育不完善，随着胎儿的生长发育，后期肾囊肿能够自行消失。如果胎儿仅有肾囊肿，而没有其他脏器异常，孕妇可以选择继续妊娠，并且做好产检，定期观察胎儿肾囊肿的变化情况。如果胎儿肾囊肿较严重，或者存在双侧肾囊肿，且伴有严重的肾盂积水，则可能无法自己吸收，而需要进行及时治疗，防止对胎儿的泌尿系统造成损害。
随着胎儿的生长发育，肾囊肿发生的概率会逐渐增加。如果胎儿出现的囊肿不是由基因畸形导致，而是一种良性病变，则与肾小管梗阻有关，体积较小的肾囊肿通常不需要进行特殊处理，因为不会对胎儿造成严重影响，部分肾囊肿会自行消失，只需定期观察即可。大部分良性肾囊肿随着胎儿年龄增长，体积会逐渐增大，但是生长速度非常缓慢，在成年以后才会出现相应的临床症状，比如腰酸、背痛、压迫肾集合系统导致肾积水等。如果肾囊肿的体积越来越大，需要进行手术治疗。
如果通过检查发现是染色体，或者基因异常导致的肾囊肿，则可能无法自行吸收，且胎儿可能会出现其他器官畸形，因此不建议继续妊娠。
如果胎儿肾囊肿不能自己吸收，建议通过羊水穿刺检查胎儿的染色体和基因情况，孕25周以后建议做脐带血穿刺检查。如果胎儿肾囊肿伴随染色体的严重异常，则建议放弃胎儿。如果胎儿的染色体正常，可以定期观察肾囊肿的变化情况，出现压迫症状后需要及时进行治疗，没有压迫症状，且胎儿大小、羊水量正常，则可以考虑继续观察。