彩超和核磁共振都属于影像学检查，不能够明确哪个更准确，两者检查项目的侧重点不同，且诊断结果需由临床医生根据经验进行判定。
如果是小器官检查或者血管检查，如甲状腺、乳腺、动脉、静脉等，彩超检查结果准确率相对核磁共振会更高，因为彩超对小器官内的病变分辨率比较高，可以发现小器官内是否有细小病变，比如囊肿，通过彩色多普勒和脉冲多普勒还可以检测出血管内血流速度以及血流方向，从而判定血管是否有异常病变。如果做的是头部检查项目，则核磁共振检查结果准确率相对于彩超更高，因为核磁共振可以通过不同平面观察脑部是否有异常病变，且对脑部疾病诊断更加全面，而由于颅骨比较厚，对超声束的传播会造成影响，因此彩超检查不能够清晰显示出脑部病变的情况。
彩超和核磁共振都属于临床上比较重要的检查项目，可为临床治疗提供参考依据。如果身体出现不适症状，需要及时去医院就诊，然后听从医生建议选择彩超或核磁共振检查。