酸奶煮沸到100℃，此时不会产生有毒有害物质，通常是能喝的。但日常不建议将酸奶加热到100℃，此时有益菌大多已经被破坏，失去了酸奶原有的营养价值。
酸奶营养价值较高，含有蛋白质、脂肪、微量元素等，其中一般还含有较多种类的益生菌。益生菌适宜在低温环境中生长，可促进胃肠道蠕动，改善肠道菌群环境。若将酸奶加热煮沸到100℃，就会导致酸奶中的益生菌被高温杀灭，影响酸奶原有食用价值。但加热并不会使酸奶生成有毒物质，喝后对身体也不会造成伤害，所以酸奶煮到100℃还能喝，但对身体的好处会有所下降。
需注意不可以过量喝酸奶，以免加重胃肠道负担，容易出现腹泻、腹痛等不适。还需注意酸奶中也含有一定的乳糖成分，若机体对乳糖不耐受，也建议避免喝酸奶，以免造成消化不良，使机体出现不适症状。