临床上，阴超又称为阴道B超检查，可以观察到子宫肌瘤病变情况。因为进行此项检查时，阴道B超探头会直接到达宫颈、阴道穹窿部位，接近子宫与卵巢，如果检查期间无其他组织或气体的干扰，成像更加清楚，适合用于检查子宫内膜病变、卵泡发育大小、宫外孕判断，以及较小的巧克力囊肿诊断。
对于存在性生活的子宫肌瘤患者，病变较大时，通过阴道B超检查难以观察肿物的全貌与邻近脏器关系，此时可以结合腹部B超共同诊断，以免误诊。当子宫肌瘤患者无明显不适症状时，只需定期随访，观察是否存在增大趋势即可，无需过度担心。当子宫肌瘤患者出现腹痛、不规则出血症状时，需及时到医院就诊，必要时进行子宫肌瘤切除术。
另外，对于没有性生活、阴道萎缩的老年患者、阴道畸形、急性阴道炎、盆腔占位性病变的患者，以及月经期患者，都不宜进行经阴道超声检查，需进行腹部B超检查。