导致一眨眼眼睛就疼的原因较多，可能与眼内存在异物、用眼过度等非疾病因素有关，还可能与长倒睫或眼睑内翻、麦粒肿或者其他眼部疾病有关，建议针对不同病因，分别进行治疗。
一、非疾病因素：
1、眼内存在异物：如结膜内存在较小的蚊虫、铁屑或者灰尘等，刺激或摩擦眼皮，进而导致一眨眼眼睛就疼。通常要避免用手揉眼睛，以免擦伤眼球，可以将上眼皮稍微向上拉，通过泪液将其冲刷出来。但如果异物位置较深，应尽快到医院由医生进行操作；
2、用眼过度：通常与长时间使用电脑、手机等电子产品，导致眼部瞬目反射以及眼肌活动减少有关，瞬目反射即面部叩打、光、角膜触觉等刺激所引起的防御反射，从而导致眼睛干涩，进而导致一眨眼眼睛就疼。一般通过局部热敷或适当休息即可缓解，还可通过滴用左氧氟沙星滴眼液进行治疗。
二、疾病因素：
1、长倒睫或眼睑内翻：通常指睫毛向眼睑内生长或翻转，可能与睡觉姿势不当有关，导致眨眼睛时，睫毛刺激或摩擦眼角膜，产生一定损伤，引起一眨眼眼睛就疼。如果症状比较轻微、生长倒睫数目较少，可以由医生将其拔除。但如果症状较为严重，对角膜刺激较大，可能还需要到医院进行激光、冷冻等手术治疗；
2、麦粒肿：又称睑腺炎，可能与免疫力降低有关。因为麦粒肿常生长在睫毛根部，或者睑板腺处，眨眼时，可能会刺激或摩擦麦粒肿，从而导致疼痛，表现为一眨眼眼睛就疼。早期可以通过局部热敷，促进结节吸收，还可滴用氧氟沙星滴眼液进行抗炎治疗。症状较严重者，还可能需要通过手术排脓；
3、其他眼部疾病：如角膜炎、睑缘炎等，通常与沾染灰尘或致病菌感染有关，由于眼睑处存在一定的炎症，眨眼时可能由于炎症刺激，会产生一定疼痛，表现为一眨眼眼睛就疼。一般需用生理盐水清洁睑缘处，并涂抹红霉素眼膏等药物，进行治疗。