坐久了阴囊根部不舒服，可能是尿路感染、前列腺炎、精索静脉曲张等因素导致。确诊后应及时进行治疗，包括药物治疗、手术治疗。在治疗期间要多休息，清淡饮食，多饮水，多排尿。
1、尿路感染：比如尿道炎，如果存在尿道炎，坐久了并且没有及时排尿，可能会导致感染加重，进而波及阴囊部位，引起阴囊根部不舒服，还可能伴有尿频、排尿疼痛等症状。若为淋菌性尿道炎，可选择头孢曲松、大观霉素等药物进行治疗。若为非淋菌性尿道炎，可选择环丙沙星、阿奇霉素等药物进行治疗。当非淋菌性尿道炎反复发作时，可选择甲硝唑、红霉素等药物进行联合治疗；
2、前列腺炎：久坐、过度手淫、过度性生活等因素，可能会诱发前列腺炎，坐久了会使前列腺充血，导致前列腺炎加重，就可引起阴囊根部不舒服，还可能伴有会阴部胀痛、尿频、尿不尽等症状，可进行药物治疗，例如普乐安片、前列舒通胶囊、阿莫西林胶囊等，并且要避免久坐，不要长时间憋尿；
3、精索静脉曲张：存在精索静脉曲张，可引起阴囊坠胀、疼痛等不适，坐久了可导致这些症状加重，就会累及阴囊根部，导致阴囊根部不舒服，表现为酸胀、疼 痛。可选择七叶皂苷钠片、地奥司明片等药物进行治疗。对于特别严重的精索静脉曲张，可考虑手术治疗，例如腹腔镜下精索静脉高位结扎术、显微镜下精索静脉结扎术等。