CT检查成像采用的是X射线，X射线存在电离辐射，达到一定剂量后，电离辐射可破坏人体内的某些大分子结构及损伤细胞，对人体产生危害。但目前临床上影像学检查所使用的射线剂量都在安全范围内，若因疾病需要，10天内做两次CT对人体通常没有明显的危害。
人体的一些器官对放射线比较敏感，比如甲状腺、晶状体、性腺等，此外儿童和孕妇等特殊人群对放射线也比较敏感。若长期大剂量的暴露在X射线内，可能会引起一些疾病，如白内障，生长发育迟缓、性腺发育障碍，严重的可癌变诱发恶性肿瘤或白血病等。但是目前CT检查使用的X射线剂量一般较小，做一次或两次CT检查接受的辐射剂量在人体可承受的安全范围内，而且目前CT设备进一步降低了辐射剂量。
两次CT检查的辐射剂量也不会超过人体的安全剂量范围，比如肺炎治疗后需要复查CT评估治疗效果，可在短期内多次CT检查。只要接受的总辐射量控制在安全范围内，就相对比较安全，对身体健康影响不大。因为接触的放射线剂量并不多，达不到损伤的剂量。建议患者听从专业医生的检查建议，不需要因为担心CT的小辐射而耽误病情，此外要做好非检查部位对X射线敏感器官的防护。