做了甲状腺穿刺总感觉不舒服，可能是由于穿刺针损伤所致，也有可能是穿刺后创口出现感染导致。出现此种情况后建议及时到正规的医院进行就诊，明确病因后采取针对性措施进行治疗。
1、穿刺针损伤：做甲状腺穿刺一般需要使用专门的穿刺针，对甲状腺部位进行穿刺取病理组织，随后进行病理学检查，根据检查结果判断病变性质。在穿刺过程中，穿刺针会刺破颈部皮肤进入甲状腺，是一种有创操作，一般会出现疼痛、肿胀、颈部不舒服的症状。如果没有出现其他不适，这种情况属于正常现象，不用过于担心；
2、感染：如果做了甲状腺穿刺后，穿刺部位没有做好日常护理，可导致细菌趁机侵入，引起炎症感染，就会导致做了甲状腺穿刺总感觉不舒服的现象，还会伴有咽部疼痛、红肿胀痛或者发热等症状。这种情况需要进行局部消毒处理，可以用无菌棉棒蘸取碘伏进行消毒，并在医生的指导下口服阿莫西林、头孢克肟分散片等抗生素进行治疗。