大便巧克力色可能与饮食、药物等非病理性因素有关，在此情况下一般无需进行特殊处理。但大便巧克力色也可能与病理性因素有关，患者需在医生的指导下，完善胃镜等相关检查，明确病因后积极进行治疗。
一、非病理性因素：
如果近期食用过多血肠、血豆腐或口服硫酸亚铁片、枸橼酸铋钾颗粒等药物，肠道内可能会生成黑色的硫化物，从而可能会导致大便巧克力色。此时可以通过改善饮食结构、合理服用药物等方法改善症状。
二、病理性因素：
1、胃溃疡：如果平时饮食不佳，比如长期吃辣椒等辛辣刺激性食物，对胃黏膜造成损伤，可能会导致胃溃疡。如果导致血管损伤，血液在肠道内可能会发生硫化，并且出现此类情况，还可能伴有胃痛等症状。对此可以通过使用奥美拉唑肠溶胶囊等药物进行缓解；
2、肝硬化：如果存在肝硬化，可能会导致门静脉高压，还可能会导致侧支循环的建立，出现食管胃底静脉曲张。如果存在此类情况的患者吃较硬的食物，导致该血管破裂出血，也可能会出现此类情况，通常患者还会伴有腹水等表现。此时可以在内镜下进行止血处理，也可使用三腔两囊管进行压迫止血。