换肤祛斑的常见后遗症是可能会导致皮肤角质层变薄，也可能会出现感染发炎现象，还可能会导致皮肤疤痕增生。故通常不建议频繁进行换肤祛斑，并且进行换肤祛斑时需要选择正规医院。
1、角质层偏薄：换肤祛斑主要是利用高密度果酸在皮肤表面进行涂抹的方法，将皮肤表面废旧角质清除，刺激新的表皮细胞长出，将皮肤表层下的斑点颗粒进行分解，达到祛除斑点目的。所以在操作过程中，皮肤表面角质层不仅会受到刺激，而且也会受到不同程度损伤。如果损伤严重，可导致皮肤角质层偏薄，从而出现明显的红血丝，除此之外还会出现易过敏的现象；
2、感染发炎：换肤祛斑后，皮肤组织比较娇嫩，且处于损伤的状态，如果此时没有做好日常护理措施，经常用手触摸皮肤，或者短时间内碰到了水，可能会导致受损皮肤感染发炎，从而出现红、肿、疼痛、烧灼感等；
3、皮肤疤痕增生：在换肤祛斑操作过程中，如果医生操作不规范，对角质细胞进行过度剥离，而且自身体质特殊，属于疤痕体质，可能会使皮肤出现疤痕增生现象，从而影响到美观。