卫生间防水味道很大是否会对身体有害不能确定，如果防水使用的材料含有对人体有害的成分，长期或大量吸入，有可能对身体有害，但如果没有存在对人体有害的成分，一般并不会对身体造成伤害。
1、无害：卫生间防水使用的材料如果符合安全标准，一般不含对人体有毒、有害的成分，即使卫生间防水味道很大，一般也不会对身体健康造成伤害。但要注意开窗通风，尽量让刺激性气体排出，以免刺激呼吸道，引发刺激性呛咳；
2、有害：如果卫生间使用的防水材料中含有有毒、有害成分，长时间吸入就有可能会对身体健康造成一定的危害，比如引起慢性中毒，也可能会引起过敏，主要表现为持续咳嗽、胸闷、呼吸困难、眼睛瘙痒等，需要及时到医院明确具体原因，接受针对性治疗。