头孢氨苄和阿莫西林都是临床中常用的抗生素，也都是半合成的化学药物，但二者在种类、作用原理以及临床应用方面都存在一定区别，因此需要患者加以区分，并在医生指导下应用。
一、种类
1、头孢氨苄：属于一种半合成的口服头孢类第一代抗生素；
2、阿莫西林：属于一种临床上比较常用的半合成青霉素类广谱抗生素。
二、作用原理
1、头孢氨苄：是通过与细菌的一个或多个蛋白相结合，抑制细菌分裂以及细胞壁的合成，从而起到抗菌作用；
2、阿莫西林：药物中的内酰胺基会水解生成肽键，并和细菌中的转肽酶结合，使之失去活性，从而影响细菌的细胞壁的合成，使细菌因为缺失细胞壁破裂溶解死亡。
三、临床应用
1、头孢氨苄：可以用于肺炎链球菌、溶血性链球菌、奈瑟菌属、大肠埃希菌、奇异变形杆菌、沙门菌属、志贺菌属、梭杆菌属等敏感菌导致的感染性疾病，例如急性扁桃体炎、咽峡炎、中耳炎、鼻窦炎、支气管炎、肺炎等呼吸道感染，以及尿路感染、皮肤及软组织感染等；
2、阿莫西林：可以用于大多数革兰氏阳性菌和革兰氏阴 性菌所导致呼吸道感染、泌尿道感染、消化道感染、皮肤和软组织感染等。