T3、T4和TSH是反映甲状腺功能的指标。其中TSH并不是由甲状腺分泌，而是脑垂体分泌的促甲状腺激素，以促进甲状腺激素的合成、释放，以及甲状腺组织的增生，TSH是由脑垂体上位中枢调控甲状腺结构和功能的指标。T3和T4分别是三碘甲状腺原氨酸与四碘甲状腺原氨酸，是由甲状腺分泌，直接反映甲状腺的功能。
T3分为FT3和TT3，T4分为FT4和TT4。FT3、FT4指游离的甲状腺素，在体内主要起着活性的甲状腺素功能。而TT3和TT4是游离甲状腺素与甲状腺结合球蛋白之后的产物，在游离的甲状腺素发挥作用时，TT3和TT4储存在身体里，等待下一步分解来发挥甲状腺素的作用。
在临床上，以上几项指标检查可以在一定程度上反映甲状腺的功能，比如最常见的甲亢患者就会表现为TSH下降，FT3、FT4、TT3和TT4升高，是原发性甲亢最典型的甲状腺功能改变。如果是垂体性甲亢的患者，则会表现为TSH与FT3、FT4、TT3和TT4均升高。常见原发性甲状腺功能减退症的患者会表现为TSH升高，FT3、FT4和TT3、TT4下降。如果是垂体性的甲状腺功能减退症，患者会表现为几项指标均下降，所以检测甲状腺功能有助于判断甲状腺的功能状态。