琥乙红霉素干混悬剂有效成分是琥乙红霉素，与阿奇霉素同属大环内酯类抗生素，二者在药物持续时间、不良反应方面，具有一定区别。
1、药物持续时间：琥乙红霉素干混悬剂代谢比较快，半衰期较短，患者需要一天使用2-4次。阿奇霉素代谢时间较长，半衰期12个小时左右，患者每天需使用1次。另外，阿奇霉素有较好的抗菌后效应，细菌可以被持续抑制；
2、不良反应：阿奇霉素副作用比琥乙红霉素干混悬剂少，对胃肠道、肝脏的影响小。琥乙红霉素干混悬剂有明显的胃肠道症状，使用后可以出现腹痛、腹泻、恶心、呕吐等情况。由于琥乙红霉素干混悬剂易引起严重的胃肠道不适，因此相比阿奇霉素临床较少使用。
琥乙红霉素干混悬剂和阿奇霉素抗菌谱比较相似，对金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌等革兰氏阳性菌，和流感嗜血杆菌、卡他莫拉菌等革兰氏阴性菌，以及沙眼衣原体、肺炎支原体等病原体，都具有抑制作用。不过阿奇霉素抗菌作用稍强于琥乙红霉素干混悬剂，具体使用哪种药物，患者需要在医生指导下选择。