睡醒后呼吸时肋骨附近疼痛，通常是由于局部压迫、软组织损伤，以及肋间神经炎、骨质疏松等因素导致，患者应在医生的指导下进行治疗，不要自己盲目处理。
1、局部压迫：如果在睡觉的时候长时间采取侧卧位睡觉，导致一侧的肋骨长期受压，就会出现局部血液循环障碍，睡醒起来之后会产生局部缺血性疼痛，患者还可伴有局部肿胀，而且呼吸活动时也会受到影响。在睡觉时患者可以采取平卧位，或者经常更换睡觉时的姿势，也可以尽量睡柔软一点的床。
2、软组织损伤：多是由于长期进行重体力活动，或者是没有进行热身就过量运动，以及运动时存在不正确姿势，导致肋骨附近的软组织受到损伤，患者在睡觉之前可能过于劳累，一时间没有注意身体发出的疼痛信号，在睡醒得到放松后，就会感觉疼痛感袭来，在呼吸时可能疼痛更甚。此时注意休息即可，不要再继续进行剧烈的活动。
3、肋间神经炎：如果患者在夜间睡觉时受凉，或者出现了感染等情况，致病菌进入呼吸道以及血液循环，通常会累及肋间神经，从而引起肋间神经炎。在晨起后意识清醒，可出现肋间神经支配区域疼痛，疼痛常呈针刺样、烧灼样，与肋间神经走行一致，呈带样分布，在呼吸的时候会牵扯到肋骨部位，所以可能会加重疼痛。患者可遵医嘱使用维生素B1片、维生素B2片、维生素B6片、维生素B12片、甲钴胺片等药物营养神经。
4、骨质疏松：如果身体长时间缺钙或者钙质流失过快，就会引起骨密度降低，骨质结构也会遭到破坏，从而增加骨的脆性，肋骨部位也容易受到影响，容易导致肋骨疼痛、骨折等情况，呼吸时胸廓会进行运动，所以会影响到肋骨。患者需要遵医嘱及时给身体补充钙剂，比如牡蛎碳酸钙片、葡萄糖酸钙片等，补充钙剂的时候可以搭配维生素D，不仅能够促进钙的吸收，还能够预防骨质疏松。
除了上述因素外，若患者在肋骨疼痛的同时，还伴随胸闷、心悸等情况，则要考虑是否存在心肌炎、心肌梗死等心脏问题，可以进行心电图检查，从而明确是否存在心脏疾病。