甲状腺过氧化物酶抗体大于1000IU/ml是高于正常值的，是否严重需要根据具体病因和病情进行分析。建议及时到医院内分泌科进一步就诊，明确病情后积极处理，以免延误治疗。
1、不严重：甲状腺过氧化物酶抗体是指甲状腺发生自身免疫性疾患，并导致滤泡破坏时，甲状腺球蛋白和甲状腺微粒体入血使机体产生的甲状腺球蛋白抗体和甲状腺微粒体抗体，是诊断自身免疫性甲状腺炎的主要指标。如果是亚急性甲状腺炎引起的一般不严重，其属于自限性疾病，通常不用特殊治疗，可自行恢复；如果是慢性淋巴细胞性甲状腺炎导致甲状腺功能减退引起的，一般通过使用左甲状腺素片等药物即可治疗，不严重；
2、严重：甲状腺过氧化物酶抗体正常值范围为0-5.6IU/ml，具体因实验室标准不一而有差异。甲状腺过氧化物酶抗体大于1000IU/ml，说明机体炎症反应比较强烈，如果甲状腺在炎症刺激作用下，出现肿大的情况，且甲状腺肿大压迫到支气管，可导致呼吸困难，严重时可导致缺氧，而危及到生命健康，这是严重的，需积极配合医生根据病因选择左甲状腺素钠片、甲巯咪唑片等药物治疗。