颅内真菌感染通常是由真菌侵入中枢神经系统引起。当患者出现此情况后，应及时前往医院的神经内科、感染科就诊，通过脑脊液检查找到致病的真菌，遵医嘱应用药物进行治疗。
颅内真菌感染最常见的入颅方式是从呼吸道吸入，形成肺部病灶，然后由肺经血行扩散。其他由内脏或皮肤黏膜引起的原发损害，由血流播散所致，也可由鼻咽、眼部及骨等邻近组织器官的病变直接蔓延入中枢神经系统。真菌种类繁多，正常人易感染新型隐球菌、球孢子菌、放线菌、芽生菌等，而颅内真菌感染最常见的病原体是新型隐球菌，所引起的疾病叫做新型隐球菌脑膜炎，可引起患者出现头痛、发热、恶心、呕吐等症状，进而可危及患者生命。
当患者出现颅内真菌感染后，可遵医嘱应用氟康唑片、伊曲康唑胶囊等药物进行治疗，还可以选择甘露醇注射液等药物脱水，避免颅内压进一步增高。对于出现真菌性肉芽肿的患者，可在医生指导下采取手术治疗。