正确使用香薰机一般对人体没有危害，能够起到助眠、舒缓压力等作用，但是如果过度使用或者是错误使用香薰机，空气中的香气浓度太高，有可能会出现流清水鼻涕、打喷嚏、胸闷、气短、胸痛、头晕等不适症状，对人体有一定的危害。
使用香薰机时多处于相对密闭的室内空间，会导致空气不流通，如果空气中的香气浓度太高，容易引起胸闷、气短、胸痛、头晕等症状，有时还会引起鼻子痒、流清水鼻涕、打喷嚏等过敏症状。另外在使用香薰机时会输出重金属物质，其他成分在燃烧时也会化成微粒散入空气中，由于其直径小，可经过呼吸道直接进入支气管，刺激呼吸道黏膜会导致呼吸道痉挛，长时间使用容易出现哮喘。而且香薰机中含有如丙酮、苯酚、甲苯、乙酸苄酯和柠檬烯等化学物质，长期以往可能会导致室内空气中铅等重金属超标，对于免疫力较低的人群来说会导致中毒，如老人、儿童等。
建议在使用香薰机的时候保持室内空气流通，勤通风，避免香薰机对室内空气质量产生影响，对人体产生危害。