通常情况下，云南白药可以用来治疗痔疮和肛裂，主要用于治疗气滞血瘀型痔疮及肛裂。目前市场上有云南白药痔疮膏专门治疗痔疮及肛裂等肛周疾病，里面的主要成分就是云南白药。
云南白药的主要成分为三七，具有化瘀止血、活血止痛、解毒消肿的作用与功效，临床上可以用来治疗气滞血瘀型内痔、混合痔、肛裂导致的便血、痔黏膜改变、炎性外痔红肿以及肛门肿痛等病症。如果痔疮脱出肛外、水肿、内有血栓形成，或有嵌顿，表面糜烂、渗液，疼痛剧烈，或表现为肛管紧缩、大便秘结、舌质紫暗或有瘀斑、脉弦或涩时，一般提示痔疮的形成与瘀血有关，需要使用活血化瘀的药物进行治疗，此时可以在医师指导下使用云南白药进行治疗。如果肛裂患者肛门刺痛明显，便时及便后尤甚，且肛门紧缩、肛管裂口紫暗、大便时有肿物脱出、舌暗苔薄、脉弦等，多提示为气滞血瘀型肛裂，一般以活血化瘀、行气止痛为治疗原则，此时可以在医师指导下使用云南白药来进行治疗。
痔疮和肛裂患者还需要自己多注意，忌食辛辣刺激食物，忌烟、酒及烧烤、火锅，尽量保持肛门处干燥、清洁，避免局部感染，并多食新鲜水果、蔬菜。