阴茎上有痦子可能是毛囊炎、皮脂腺痣、色素痣、尖锐湿疣等情况引起，患者可以在医生的指导下，采取相应的治疗措施，加快疾病康复，改善不适症状。
1、毛囊炎：若平时不注意卫生，局部清洁不当，可能会感染致病菌，形成毛囊炎。在炎症的刺激下，阴茎处的毛囊部位可能会形成化脓性丘疹。患者可在医生指导下局部使用莫匹罗星软膏等药物涂抹，配合服用克拉霉素胶囊等药物。
2、皮脂腺痣：如果阴茎部位皮脂腺发育异常，会出现圆形或带状损害，可能会随生长发育，损害增厚变大，皮脂腺痣者可以在医生指导下采用激光、电灼或手术切除等方法治疗，对于小范围病变的患者，也可以采用冷冻等方法治疗。
3、色素痣：由于生活习惯不良好或基因缺陷，可能会导致细胞分化异常，皮肤表面沉积色素，从而出现不溶性黑色素，形成色素痣。色素痣可以发生在人体的皮肤和黏膜上，如果色素痣出现在阴茎上，阴茎上可能会出现痦子。若色素痣较小且颜色较浅，患者可以进行激光治疗，若色素痣比较大，颜色较深，患者可以在医生的建议下进行切除手术。
4、尖锐湿疣：若性生活不卫生，可能会感染人乳头瘤病毒，形成尖锐湿疣，病毒可能会导致皮肤黏膜出现乳头状的肉粒，形似痦子。患者可以在医生的指导下进行手术治疗，去除疣体，以防复发。
除上述情况外，血管瘤的患者也可能会导致阴茎上长了一个痦子，血管瘤是血管内皮细胞增殖、凸起的一种血管肿瘤性病变，对于局限性、能直接切除缝合的小病灶者可以在医生指导下进行外科切除，浅表型血管瘤也可以在医生指导下进行激光治疗，如脉冲染料激光等，对于良性或交界性血管瘤者也可以进行放射治疗，恶性血管瘤患者可以遵医嘱静脉注射化疗药物，如注射用盐酸吉西他滨等。
建议前往医院男科就诊，完善皮肤镜检查，遵医嘱进行治疗。患者在治疗期间要保持良好的心态，避免食用辛辣、油腻食物，如辣椒、肥肉等，注意饮食清淡、健康，以免加重炎症反应。