青光眼之所以不能用阿托品，主要是因为使用该药物可能会导致青光眼急性发作。但如果青光眼患者进行了手术治疗，在手术后可遵医嘱应用阿托品，有利于眼内结构恢复。
阿托品属于一种睫状肌麻痹剂，在使用阿托品后会导致瞳孔散大，虹膜组织向周围堆积，致使角膜与虹膜之间的间隙、夹角变小。而青光眼患者，尤其是原发闭角型青光眼患者，虹膜与角膜之间较窄，同时伴有窄房角、浅前房等情况。当瞳孔散大后，会阻碍房水引流，使房水不容易进入前房角， 进而流出球外，很可能会诱发青光眼急性发作。
青光眼患者应及早进行手术治疗，而患者在手术后，尤其是炎症反应比较严重时，需要遵医嘱应用阿托品。主要是因为青光眼手术后，患者眼内结构产生了改变，房水不再需要经由前房角引流，此时可遵医嘱应用阿托品，有利于使患者的睫状肌松弛、前韧带变短，可使后房、前房加深，有利于促使眼内结构尽快恢复。