早上起来发现尿液是红褐色的，可能是月经来潮、食物因素、药物因素、尿道炎、膀胱结石等原因引起的。建议明确具体原因，然后采取针对性处理措施。
1、月经来潮：女性月经来潮时，由于有经血排出，尿道与阴道位置相邻，便可能使经血进入尿液中，导致尿液颜色改变。月经周期过后便能够恢复正常，不需要进行调理；
2、食物因素：若在晚上睡觉前食用较多红心火龙果，由于火龙果当中含有大量的天然色素，不被人体所吸收，在早上排尿时就会出现红色，但是没有其他临床症状。一般不用进行治疗，多次排尿后可逐渐缓解；
3、药物因素：若患者本身存在肺结核等疾病，需要口服利福平片等药物进行治疗。由于利福平片产生的代谢产物会通过尿液排出，所以会导致尿液的颜色变为红褐色。此类情况也属于正常生理现象，停止用药以后，尿液颜色会自行恢复正常；
4、尿道炎：可能与不洁性生活或不注意卫生有关，通常会急性发作，感染较为严重时可导致局部尿路组织破损出血，尿液会变红，还伴有尿频、尿急、尿痛等症状。确诊后可遵医嘱使用头孢地尼分散片、注射用头孢曲松钠等药物进行针对性治疗；
5、膀胱结石：可能与饮水较少等因素有关，会导致膀胱内出现结石。早晨起床时由于体位改变，结石对膀胱造成刺激与损伤，还伴有排尿疼痛、排尿困难等症状。此时应当加大饮水量，多排尿，促进结石自行排出。当结石无法自行排出时，可考虑进行体外冲击波碎石，必要时需进行手术取石，比如耻骨上切开取石术。
此外，膀胱癌或女性宫颈癌、子宫内膜癌，以及男性前列腺癌等疾病，也可能导致上述症状。建议患者积极就医，完善检查后遵医嘱进行治疗。