乙肝疫苗一般按照0、1、6的程序接种3剂，即接种第1针之后满1个月后接种第2针，满6个月后接种第3针。乙肝疫苗不建议推迟接种，如果在该接种的时间出现接种禁忌证，如发热等，则需推迟接种，否则可能会与发热疾病互相干扰，还可能会影响抗体的产生。若为婴幼儿则可能出现急慢性严重疾病，如荨麻疹、营养不良等，需要等待病情治愈2周左右后再进行乙肝疫苗接种。
乙肝疫苗接种完成后可以检测乙肝表面抗体滴度水平，数值越高越好。接种乙肝疫苗和注射乙型肝炎免疫球蛋白，是预防乙肝感染较为有效的预防措施。如果没有特殊情况，建议在规定时间内完成乙肝疫苗的接种。