肛瘘术后50天还有分泌物，有可能是手术创面没有愈合的表现，也有可能是肛瘘复发、手术创面感染的表现，需要根据具体情况，选择适合的方法进行治疗。
1、手术创面未愈合：由于肛瘘属于感染性疾病的范畴，所以术后的伤口不允许进行缝合处理，需要开放伤口引流，定期换药消毒，才可以逐渐愈合。由于肛瘘术后在肛门直肠部位有明显的开放性伤口，患者会自觉肛门口有明显的分泌物，这属于正常的现象。随着时间延长以及伤口的愈合，局部分泌物会逐渐减少，最终完全消失。如果肛瘘的瘘管数量比较多，位置比较高，术后的手术创面就会相对较大，愈合所需要的时间就会较长，有可能术后50天还会有少量分泌物。建议继续行伤口部位的消毒换药，促进愈合即可；
2、肛瘘复发：肛瘘患者行手术治疗之后也有复发的可能性，之所以会出现复发，有可能与瘘管遗漏有关，还可能与术后患者没有积极配合伤口换药，进而导致假性愈合有关。肛瘘一旦复发，位于肛瘘口附近的瘘管外口可能在术后50天排出分泌物，需要再次进行手术治疗，比如行肛瘘切除术、瘘管切开术等；
3、手术创面感染：肛瘘术后恢复 期，创面可能被病原菌感染，引起创面红肿热痛、有分泌物等症状，分泌物通常是脓液。建议及时就医，遵医嘱使用阿莫西林胶囊、甲硝唑片等药物抗感染，另外定时清洁换药，促进恢复。