中耳炎一般是由细菌感染引起，可以首选青霉素类或头孢类抗生素治疗。如果中耳炎口服头孢克肟治疗无效，可能是有并发症，如急性乳突炎或急性迷路炎、鼓膜穿孔等，还可能是其他病原体感染引起，包括病毒感染、真菌感染，需要查明原因后进行针对性治疗。
一、并发症
1、急性乳突炎或急性迷路炎：耳部细菌毒性较强，可能引起急性乳突炎或急性迷路炎等，口服头孢克肟无法控制耳部感染，需要静滴抗生素治疗。若仍未改善需行乳突CT检查，了解有无乳突骨质破坏或胆脂瘤形成，明确后需要行耳部手术治疗；
2、鼓膜穿孔：如果鼓膜穿孔较小或者为鼓膜松弛部穿孔，脓液引流受阻，单纯口服头孢克肟治疗一般无效，需要应用双氧水滴耳液滴耳，将中耳及外耳道内脓液冲出，联合盐酸左氧氟沙星滴耳液滴耳，再口服头孢克肟或阿莫西林进行抗炎治疗。
二、其他病原体感染
1、病毒感染：如果中耳炎是由病毒感染引起，如大疱性鼓膜炎，则服用头孢克肟起不到治疗效果，主要是需要进行抗病毒治疗，还可以在无菌操作下将大疱刺破，也可以配合局部或全身抗生素进行治疗，防止继发细菌感染；
2、真菌感染：此时服用头孢克肟也无效果，需要取外耳道内分泌物送检确诊，明确后用双氧水滴耳液滴耳，氟康唑注射液进行耳浴治疗。