眨眼睛的时候眼睛痛可能是由于长时间凝视屏幕或书本使眼周肌肉僵化，而导致眨眼的时候眼周肌肉被牵扯而出现疼痛。通常多眨几下眼睛活动一下即可缓解。如果是经常眨眼疼痛且休息后不缓解，则可能是眼睛异物、眼部疾病或其他疾病导致。
一、眼睛异物：
如眼睛进入了灰尘、蚊虫、脱落的睫毛或者隐形眼镜长时间未更换等，都可刺激眼睛导致眨眼时疼痛。
二、眼部疾病：
1、结膜炎：各种原因导致的结膜发炎，由于炎症刺激可能引起眼干、眼痛等症状，在眨眼时疼痛可能更为明显；
2、角膜炎：角膜防御能力减弱时导致的炎症，可以刺激眼球引起眼部的干痒、疼痛，以及眼睑痉挛，造成眨眼时眼部疼痛；
3、眼睑炎：临近组织的炎症蔓延而来形成的眼睑炎，在眨眼时炎症对于眼睑的刺激更加剧烈而形成疼痛；
4、其他疾病：眼睛其他组织的炎症，如麦粒肿、虹膜睫状体炎等，也可导致眨眼的时候刺激到眼睛，引起疼痛的症状。此外，如果眼部有霰粒肿、倒睫或者眼结石的话，也会刺激眼部神经而导致眨眼的时候出现疼痛、异物感。
三、其他部位疾病：
1、干燥综合症：如果是患有干燥综合征的患者，往往由于泪腺分泌黏蛋白减少而导致眼干、眼涩，眨眼时还会出现疼痛；
2、鼻窦炎：鼻窦炎感染活动期或症状较重时，可以向周围组织蔓延而导致头部、面部以及眼睛疼痛，可能与眨眼无关。
此外，眼部外伤或者中医方面所说的上火等，均可导致患者眨眼睛的时候眼睛痛。由于此类症状并不具有特异性，所以如患者能够在短时间内通过休息缓解，通常是眼部疲劳引起，无需特殊治疗。如部分患者症状持续或加重，疼痛感明显时，应积极前往医院接受眼部检查和治疗。