出现五更泻的患者通常使用中药方剂附子理中丸进行治疗，有健脾止泻的作用；还可应用四神丸进行治疗，是较为经典治疗五更泻的中成药。五更泻现在认为多是脾肾阳虚导致的，主要表现快天亮时患者出现腹痛、腹部不适、肠鸣亢进等症状，通常大便呈稀水样。
附子理中丸，由附子、人参、干姜、白术等中药制成，有温阳祛寒、益气健脾的功效。除此之外，患者也可服用四神丸，主要成分为补骨脂、肉豆蔻、吴茱萸、五味子等，可以起到健脾温肾、温中止泻的作用。在临床上患者出现五更泻可能不会仅使用四神丸治疗，可能要进行加减例如与参苓白术丸合用，可能会获得更好的疗效。
肾为先天之本，脾为后天之本，肾阳不足导致五更泻的患者通常还合并有脾阳不振、脾阳虚弱等，脾阳与肾阳二者相辅相成。因此，在治疗五更泻时，除温补肾阳外，还要温补脾阳、振奋中阳，才能取得较好的治疗效果。