沉香灸和艾灸的原料不同、功效不同，价格也不同。沉香灸实际是艾灸的延伸，是在艾绒中加入沉香制成的艾条，点燃使用的时候通常会出现沉香的香味，兼具了艾灸和沉香两种药物的使用价值。
1、原料不同：沉香灸的主要原料是沉香粉、艾绒，艾灸的主要原料是艾绒，沉香灸在点燃使用的时候通常会出现沉香的香味；
2、功效不同：沉香灸具有行气止痛、温中止呕、纳气平喘等功效，用于治疗胸腹胀满、胃寒、呕吐、肾虚、气喘等病症，主要功效是顺气、降气。艾灸具有温经止痛、扶阳固脱、防病、保健的功效，艾灸中可以添加其他的药物扩展艾灸的治疗范围，作用范围比沉香灸广泛；
3、价格不同：沉香灸中有沉香，沉香是比较贵重的一种药物，一般应用比较少，价格较高。艾灸主要成分是艾绒，价格可能较低。
如果想要进行沉香灸或者艾灸，应注意温度不宜过高，避免烫伤局部皮肤，灸治后注意保暖，防止着凉。如果机体处于饥饿、疲劳、精神紧张状态，不宜立即进行灸治，如果皮肤有感染、溃疡、瘢痕、出血倾向及高度水肿者，局部不宜进行灸治，如果灸治后出现局部烫伤，应及时进行处理。