磁共振检查只是一种影像学检查手段，用于疾病诊断，因此不存在对身体好与坏的说法。同时，磁共振检查并不存在电离辐射，尚未有磁共振检查对人体有损伤的报道，所以磁共振检查一般对人体无损伤，无需过度担心。
磁共振检查又称核磁共振检查，其中的“核”不同于核辐射的“核”。其将人体置入一个强大的磁场中，通过磁场发出射频脉冲激发人体内的氢原子核发生共振，当把外界的射频脉冲撤离后，人体内的氢原子核便恢复到原来的状态而释放能量，通过如此反复施加和去除射频脉冲产生信号，使用接收器接收这种信号，经后处理获得MRI图像。磁共振检查不像CT检查采用X射线，存在电离辐射损伤，而是应用磁场，属于电磁波无电离辐射损伤，所以磁共振检查没有辐射，比较安全，一般不会对人体造成损伤，对身体也没有坏处。
磁共振检查具有多参数成像、任意断层成像、无骨伪影干扰、多功能成像及无电离辐射损伤等特点，已广泛应用于临床多个部位疾病的诊断检查，常用于检查神经系统，如脑梗死、脑肿瘤、脑炎及先天性发育异常等；骨关节系统，如关节软骨、韧带、关节炎、椎间盘突出及椎管占位等；腹部疾病，如肝脏、胆囊、胰腺、脾脏、肾脏及输尿管等；盆腔及生殖系统，如女性子宫、卵巢及男性前列腺等。