通常情况下，甲硝唑芬布芬胶囊副作用会在2-8天消失，具体时间和所引发的副作用严重程度以及个人体质等因素有关，要根据具体情况进行分析。
甲硝唑芬布芬胶囊的主要成分是甲硝唑以及芬布芬，可以用于治疗牙龈炎以及牙周炎，对于口腔炎和舌炎也有一定作用，但是部分患者在用药以后可能会出现胃肠道反应，如胃痛、恶心、食欲下降等，还可能会出现皮肤瘙痒、头晕、发热、排尿困难等副作用，严重时甚至会引发周围神经病变。如果患者用药后出现的副作用比较轻微，并且个人体质比较好，能够加快药物在体内的代谢，副作用一般在2天左右就能消失。如果患者在用药后出现了严重的副作用，或者个人体质较差，影响到药物的代谢，副作用所持续的时间也会较长，可能需要8天才会消失。甲硝唑芬布芬胶囊需要遵医嘱用药，如果患者有活动性消化道溃疡或者重度心力衰竭、活动性中枢神经病变、严重肝肾功能异常等，一般不可以用药，以免增加身体负担，孕妇以及哺乳期患者也需要禁用此药。
患者在用药期间不可以同时服用其他非甾体类抗炎药，如布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠缓释片等，以免发生药物相互作用。