宝塔糖常见的有磷酸哌嗪宝塔糖或盐酸左旋咪唑宝塔糖，二者都有副作用，且副作用相似，但后者副作用可能会相对轻。宝塔糖因其形状像宝塔，故而得名，作用机理是使肠虫麻痹，促进肠虫从肠道排出。虽然宝塔糖名字里有糖，但宝塔糖是一种药物，而且具有较多的副作用，因此不能随便吃，以免发生不良反应。
1、消化道症状：表现为恶心、呕吐、腹痛、腹泻等，这些症状一般在停药后可自行消失；
2、过敏：部分儿童服用宝塔糖后会出现红色皮疹、流涕、哮喘、咳嗽等症状，一般停药后此类过敏症状可自行缓解，必要时可使用抗过敏药物对症处理，但如果出现严重过敏反应，如喉头水肿、休克等，需要及时就医；
3、肝损害：少部分儿童会出现肝损害，表现为食欲不振，甚至出现黄疸、手足瘙痒等，出现药物性肝损害时需要到医院去检测肝功能，必要时给予护肝、保肝治疗；
4、神经毒性：如果频繁服用宝塔糖，可能会对神经肌肉产生毒性，造成睡眠障碍、肌肉酸痛、瞳孔缩小等。
吃宝塔糖注意不能过量、过长时间服用，一定要在医师的指导以及家长的监督下服用。还需要注意服用时间，可以 在晨起或饭后两小时服用，驱虫效果较好，服药期间尽量避免辛辣、刺激性大的食物，本身营养不良、贫血的儿童不适宜服用宝塔糖。此外，两岁以下的儿童感染肠虫的几率较小，而且肝功能发育不成熟，容易造成肝功能损害，也不适宜服用宝塔糖。