孢子和假菌丝是霉菌的两个不同生长发育阶段，因此此处孢子应是指霉菌孢子。霉菌孢子和假菌丝广泛存在于正常人的皮肤、口腔、鼻咽部、胃肠道和阴道等处，可以通过内源性途径感染。另外，霉菌孢子和假菌丝也广泛存在于自然界的土壤、医院环境、各种用品表面及食物等处，可以通过外源性途径引起感染。
1、内源性途径：内源性途径感染较多见，霉菌是人体的正常菌群，属于条件致病菌，在机体免疫功能正常时，通常不致病。在机体免疫功能下降，或者有糖尿病、恶性肿瘤等基础疾病时，以及应用细胞毒性免疫抑制剂、长期大量使用广谱抗生素及长期导管留置的患者，霉菌孢子和假菌丝会大量增殖，并侵袭周围组织，引起自身感染，常见感染部位是消化道和肺部；
2、外源性途径：包括性传播、垂直传播、水性作业等，也可通过医护人员、医疗器械等间接接触感染，还可通过饮水、食物等方式进行传播。
如果发生霉菌孢子和假菌丝感染，应积极遵医嘱使用广谱抗真菌药物进行治疗，如氟康唑片、伏立康唑片等，也可以使用注射用两性霉素B脂质体进行治疗，以及选择棘白菌素类药物进行治疗，如注射用醋酸卡泊芬净、注射用米卡芬净钠等。